Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr412-202ENSMUST00000216362 1786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Ankfn1-202ENSMUST00000128717 2391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Cacfd1-201ENSMUST00000114003 727 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm12385-201ENSMUST00000117439 795 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Sla-204ENSMUST00000168522 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gstm5-204ENSMUST00000169365 810 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Mir7655-201ENSMUST00000183376 58 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm9322-201ENSMUST00000188144 958 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 AC123944.1-201ENSMUST00000213414 160 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 AC153569.1-201ENSMUST00000215873 807 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 4930428N03Rik-201ENSMUST00000038250 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28038F7BCN9 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms