Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms