Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
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