Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms