Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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