Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms