Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms