Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms