Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4921517D22Rik-201ENSMUST00000061597 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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