Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Yipf3Q3UDR8 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms