Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ufm1P61961 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ufm1P61961 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ufm1P61961 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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