Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pabpc1P29341 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 457.5 ms