Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm37155-201ENSMUST00000192152 406 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PdgfaP20033 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 H2-M10.4-202ENSMUST00000169950 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm20686-201ENSMUST00000175846 535 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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PdgfaP20033 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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PdgfaP20033 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm44610-201ENSMUST00000209012 3827 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms