Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RhoP15409 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms