Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms