Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P10404 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms