Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CrxO54751 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CrxO54751 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CrxO54751 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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