Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
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