Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Use1Q9CQ56 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Use1Q9CQ56 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Use1Q9CQ56 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Use1Q9CQ56 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Use1Q9CQ56 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Use1Q9CQ56 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Use1Q9CQ56 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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