Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp11Q99K46 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp11Q99K46 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms