Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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