Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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