Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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