Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc88cQ6VGS5 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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