Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.9 ms