Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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Hoxa13Q62424 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Hoxa13Q62424 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Hoxa13Q62424 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Hoxa13Q62424 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms