Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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