Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cux1P53564 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cux1P53564 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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