Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms