Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxc11P31313 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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