Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RxraP28700 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms