Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cmah-201ENSMUST00000050859 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Vwa3b-203ENSMUST00000117172 1636 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms