Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RhoP15409 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RhoP15409 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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