Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
P10404 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P10404 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms