Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms