Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms