Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms