Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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