Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Usp49Q6P9L4 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Usp49Q6P9L4 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Usp49Q6P9L4 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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