Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Q3U6N9 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms