Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P58686 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P58686 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms