Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dbx1P52950 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dbx1P52950 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms