Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cd28P31041 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms