Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Gm8356J3QPD3 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Gm8356J3QPD3 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Gm8356J3QPD3 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Gm8356J3QPD3 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms