Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-M5A7VMS3 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms