Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Q9CQC3 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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