Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms