Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms