Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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NipblQ6KCD5 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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