Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Usp19Q3UJD6 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms